La sacra Arca dell'Alleanza e tutti gli interrogativi che solleva, che cos'è, perché è stata costruita, dove si trova, è il tema della controversa tesi dell'autore. Per seguire le origini e il percorso dell'Arca dell'Alleanza Gardner affronta i temi biblici relativi alla storia del popolo d'Israele (l'Esodo, re Salomone, Mosè, la Regina di Saba), nella misura in cui vi siano riferimenti all'Arca. Dalla terza parte del volume in poi, l'autore passa invece a descrivere le implicazioni più strettamente scientifiche relative al miracoloso materiale di cui l'Arca sarebbe stata composta, confrontando la sua tesi con elementi di quantistica moderna, ma anche con documenti e testimonianze di altra natura.